Prej neznani sarbekovirus, odkrit pri netopirjih v Veliki Britaniji

Prej neznani sarbekovirus, odkrit pri netopirjih v Veliki Britaniji
Prej neznani sarbekovirus, odkrit pri netopirjih v Veliki Britaniji
Anonim

Znanstveniki so odkrili nov sarbekovirus RhGB01, potem ko so pregledali le 53 vzorcev iztrebkov iz podkovnjakov, s čimer so razširili geografski in vrstni obseg koronavirusov, kot sta SARS-CoV in SARS-CoV-2. Domnevno jih bomo našli v celotnem območju Rhinolophidae - od Avstralije in Japonske do Evrope in Afrike.

Več kot leto kasneje vir trenutnega izbruha koronavirusa kljub tisočim študijam, poročilom WHO, preiskavam in še več ni znan. Podkovni netopirji (Rhinolophus) veljajo za naravne gostitelje tako za SARS-CoV (hud akutni respiratorni sindrom, ki se je pojavil leta 2002) kot za naš SARS-CoV-2, vendar ni bil ugotovljen noben vmesni nosilec, ki je virus prenašal na ljudi.

Obseg netopirjev pokriva večino starega sveta, vendar je bil večina vzorcev predhodno odvzetih v vzhodni in jugovzhodni Aziji: tam je bilo v desetih vrstah netopirjev odkritih približno 50 koronavirusov, povezanih s SARS, od tega 48 v devetih različnih podkve netopirji. Filogenetska analiza novih sarbekovirusov-to je koronavirusov, povezanih s SARS-v obliki podkve na Kitajskem je pokazala, da so najbolj tesno povezani ravno s SARS-CoV in SARS-CoV-2.

Znanstveniki z Univerze v vzhodni Angliji so se odločili dopolniti te podatke. Avtorji študije, ki je bila včeraj objavljena v Scientific Reports, so avgusta in septembra 2020 v Somersetu, Monmouthshireu in Walesu zbirali iztrebke več deset majhnih živali v obliki podkve. Živali so ujeli s pastmi ali mrežami, ki so bile postavljene v bližini gozdov in v gozdovih.

Iztrebke smo dali v posamezne sterilne epruvete, ki vsebujejo raztopino RNAlater za stabilizacijo RNA, ohladili in shranili zamrznjene pred analizo. Znanstveniki so nato izvedli sekvenciranje genoma, ki je v enem od 53 vzorcev identificiral prej neznan virus. Imenovali so ga RhGB01. Virus vsebuje 10 kodirnih genov, medtem ko SARS-CoV in SARS-CoV-2-11 kodirajočih genov z vključitvijo proteina ORF8.

"Filogeneza proteinskih konic in nukleotidnih zaporedij je pokazala, da je RhGB01 združen v monofiletični kladi z BM48-31 / BGR / 2008, sarbekovirusom podkvastega netopirja Blasius (Rhinolophus blasii), odkritega leta 2008 v Bolgariji. RhGB01 se razlikuje od kladov, ki vsebujejo patogene humane beta-koronaviruse SARS-CoV in SARS-CoV-2, vendar je tesneje povezan s koronavirusom, povezanim s hudim akutnim respiratornim sindromom, "pišejo znanstveniki.

Glavni receptor za prodor SARS-CoV in SARS-CoV-2 v telo ostaja encim ACE2, to možnost mu daje motiv, ki veže receptor (RBM) znotraj domene, ki veže receptor (RBD) S -protein - tvori ovoj virusa. Novi RhGB01 ima 68% oziroma 67% identiteto aminokislin z RBD SARS-CoV oziroma SARS-CoV-2, vendar le 43% in 48% podobno kot pri RBM. Za primerjavo: najbližji virusi, povezani s SARS-CoV-2, netopirji in pangolini imajo 89% in 86% sovpadanje z RBD SARS-CoV-2 in 75, 77% s SARS-CoV. Poleg tega RhGB01 kaže malo podobnosti RBM z virusom respiratornega sindroma na Bližnjem vzhodu (MERS). Vendar nima dodatnega mesta cepitve furina na stičišču proteinov S1 in S2, ki je specifičen za SARS-CoV-2.

»Nizka stopnja podobnosti, pomanjkanje kontaktnih ostankov in strukturne razlike v primerjavi s domeno, ki veže receptorje SARS-CoV in SARS-CoV-2, najverjetneje kaže na pomanjkanje sposobnosti vezave na ACE2. Zato RhGB01 verjetno ni zoonotičen, če ni mutiran. Toda testi in vitro so potrebni za eksperimentalno potrditev pomanjkanja vezave na ACE2 ali druge receptorje v človeških celicah in za določitev sposobnosti vezave na druge receptorje ACE2 pri sesalcih, «so zapisali avtorji študije.

Čeprav se zdi, da RhGB01 obstaja že tisočletja, so znanstveniki prepričani, da je vredno okrepiti nadzor nad koronavirusi pri podkvastih netopirjih po vsem njihovem območju, pa tudi pri drugih vrstah netopirjev. Navsezadnje sta se tako SARS-CoV kot SARS-CoV-2 razvila kot posledica mutacije, homologne rekombinacije (izmenjava nukleotidnih sekvenc med dvema podobnima ali enakima kromosoma) in "prehajanja" skozi vsaj enega vmesnega gostitelja.

To pomeni, da je predhodnik virusa naravnega gostitelja prejel genetsko prilagoditev, ki je omogočila uspešno okužbo ljudi in prenos med nami. In kjer obstaja možnost homologne rekombinacije sarbekovirusov s sočasno okužbo, obstaja nevarnost novih zoonoz.

»Vsak netopir, ki nosi virus, podoben SARS, lahko postane kotliček za mutacije. In če se netopirji z RhGB01 okužijo s SARS-CoV-2, obstaja nevarnost hibridizacije teh virusov-in pojavil se bo nov, ki bo že lahko okužil ljudi, «so zaključili raziskovalci.

Priporočena: